Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.9 ms