Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14899-201ENSMUST00000118673 548 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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