Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Gga3Q8BMI3 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Gga3Q8BMI3 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms