Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
Soga3Q6NZL0 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Soga3Q6NZL0 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.5 ms