Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
H2-Q1O19441 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
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H2-Q1O19441 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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H2-Q1O19441 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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H2-Q1O19441 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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H2-Q1O19441 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
H2-Q1O19441 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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