Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.4 ms