Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RpainQ9CWY9 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
RpainQ9CWY9 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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