Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm22073-201ENSMUST00000122668 189 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
AK157302I3ITR1 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.2 ms