Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord14a-201ENSMUST00000082807 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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