Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Irx2P81066 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm29865-201ENSMUST00000197726 451 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm23112-201ENSMUST00000158606 125 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Irx2P81066 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.9 ms