Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
AK157302I3ITR1 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AK157302I3ITR1 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.9 ms