Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir6904-201ENSMUST00000183443 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Col5a3Q9JLI2 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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