Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 AC122320.1-201ENSMUST00000227233 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RpainQ9CWY9 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24482-201ENSMUST00000117005 93 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24131-201ENSMUST00000158539 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RpainQ9CWY9 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
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