Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Trim58Q5NCC9 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Trim58Q5NCC9 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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