Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Gm27761-201ENSMUST00000184091 131 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-Q1O19441 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-Q1O19441 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
H2-Q1O19441 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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H2-Q1O19441 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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H2-Q1O19441 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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H2-Q1O19441 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
H2-Q1O19441 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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