Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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PtprbB2RU80 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PtprbB2RU80 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
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PtprbB2RU80 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Mir344-201ENSMUST00000083634 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprbB2RU80 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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