Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Uspl1Q3ULM6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uspl1Q3ULM6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uspl1Q3ULM6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uspl1Q3ULM6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms