Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Xrn1P97789 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms