Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Rnft1Q9DCN7 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Rnft1Q9DCN7 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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