Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nde1Q9CZA6 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.5 ms