Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rpusd4Q9CWX4 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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