Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC158523.1-201ENSMUST00000221398 328 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Ecm2-201ENSMUST00000051504 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Rpusd2Q149F1 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.6 ms