Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm23148-201ENSMUST00000180367 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm27645-201ENSMUST00000183348 77 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm27828-201ENSMUST00000184108 119 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm37763-201ENSMUST00000193445 120 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm25078-201ENSMUST00000082530 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
RpainQ9CWY9 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.81
RpainQ9CWY9 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
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