Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PtprbB2RU80 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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