Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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Rnf4Q9QZS2 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Rnf4Q9QZS2 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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