Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ptx4Q6RUU0 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ptx4Q6RUU0 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ptx4Q6RUU0 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ptx4Q6RUU0 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ptx4Q6RUU0 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ptx4Q6RUU0 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ptx4Q6RUU0 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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