Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc30Q8BVF4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms