Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Knl1Q66JQ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Knl1Q66JQ7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms