Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms