Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kdm2aP59997 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kdm2aP59997 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms