Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rfx7F8VPJ6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rfx7F8VPJ6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rfx7F8VPJ6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms