Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm11490-201ENSMUST00000118128 272 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trim58Q5NCC9 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Trim58Q5NCC9 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm26194-201ENSMUST00000175036 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Trim58Q5NCC9 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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