Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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Rnft1Q9DCN7 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
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Rnft1Q9DCN7 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Rnft1Q9DCN7 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Rnft1Q9DCN7 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Rnft1Q9DCN7 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Rnft1Q9DCN7 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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