Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Olfr731-201ENSMUST00000059565 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Trim58Q5NCC9 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr1025-ps1-202ENSMUST00000213474 3578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Trim58Q5NCC9 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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