Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Rnft1Q9DCN7 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r90-207ENSMUST00000227692 7101 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Cp-204ENSMUST00000108328 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm28921-201ENSMUST00000190219 378 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Rnft1Q9DCN7 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.9 ms