Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc30Q8BVF4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc30Q8BVF4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms