Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm9sf4Q8BH24 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm9sf4Q8BH24 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms