Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mdc1Q5PSV9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms