Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt-3.94□□□□□ -3.04
TY1B-BLQ12490 snR62snR62 100 nt-4.08□□□□□ -3.06
TY1B-BLQ12490 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-4.09□□□□□ -3.06
TY1B-BLQ12490 YOR225WYOR225W 330 nt-4.13□□□□□ -3.07
TY1B-BLQ12490 snR64snR64 101 nt-4.14□□□□□ -3.07
TY1B-BLQ12490 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt-4.17□□□□□ -3.08
TY1B-BLQ12490 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt-4.18□□□□□ -3.08
TY1B-BLQ12490 YNL170WYNL170W 396 nt-4.19□□□□□ -3.08
TY1B-BLQ12490 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt-4.23□□□□□ -3.09
TY1B-BLQ12490 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-4.27□□□□□ -3.09
TY1B-BLQ12490 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt-4.27□□□□□ -3.09
TY1B-BLQ12490 YLR294CYLR294C 330 nt-4.3□□□□□ -3.1
TY1B-BLQ12490 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt-4.31□□□□□ -3.1
TY1B-BLQ12490 snR61snR61 90 nt-4.32□□□□□ -3.1
TY1B-BLQ12490 snR40snR40 97 nt-4.34□□□□□ -3.1
TY1B-BLQ12490 YNL338WYNL338W 159 nt-4.39□□□□□ -3.11
TY1B-BLQ12490 Q0144Q0144 330 nt-4.48□□□□□ -3.13
TY1B-BLQ12490 Q0032Q0032 291 nt-4.61□□□□□ -3.15
TY1B-BLQ12490 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-4.69□□□□□ -3.16
TY1B-BLQ12490 snR53snR53 91 nt-4.72□□□□□ -3.16
TY1B-BLQ12490 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-5.12□□□□□ -3.23
TY1B-BLQ12490 YMR326CYMR326C 309 nt-5.2□□□□□ -3.24
TY1B-BLQ12490 YHR217CYHR217C 462 nt-5.31□□□□□ -3.26
TY1B-BLQ12490 Q0143Q0143 153 nt-5.62□□□□□ -3.31
TY1B-BLQ12490 ATP8Q0080 147 nt-5.75□□□□□ -3.33
TY1B-BLQ12490 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-6.11□□□□□ -3.39
TY1B-BLQ12490 YBL109WYBL109W 336 nt-6.16□□□□□ -3.39
TY1B-BLQ12490 snR75snR75 89 nt-6.2□□□□□ -3.4
TY1B-BLQ12490 Q0092Q0092 141 nt-6.49□□□□□ -3.45
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.3 ms