Protein–RNA interactions for Protein: Q12292

ATG34, Autophagy-related protein 34, yeastyeast

Predictions only

Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG34Q12292 YHR217CYHR217C 462 nt-1.55□□□□□ -2.66
ATG34Q12292 snR64snR64 101 nt-1.58□□□□□ -2.66
ATG34Q12292 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt-1.58□□□□□ -2.66
ATG34Q12292 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt-1.61□□□□□ -2.67
ATG34Q12292 snR85snR85 171 nt-1.62□□□□□ -2.67
ATG34Q12292 YGR122C-AYGR122C-A 129 nt-1.64□□□□□ -2.67
ATG34Q12292 tV(UAC)QtV(UAC)Q 76 nt-1.64□□□□□ -2.67
ATG34Q12292 YOR309CYOR309C 381 nt-1.69□□□□□ -2.68
ATG34Q12292 YBL109WYBL109W 336 nt-1.71□□□□□ -2.68
ATG34Q12292 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt-1.72□□□□□ -2.68
ATG34Q12292 snR6snR6 112 nt-1.77□□□□□ -2.69
ATG34Q12292 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.84□□□□□ -2.7
ATG34Q12292 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.87□□□□□ -2.71
ATG34Q12292 snR73snR73 106 nt-1.94□□□□□ -2.72
ATG34Q12292 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.94□□□□□ -2.72
ATG34Q12292 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-1.95□□□□□ -2.72
ATG34Q12292 snR53snR53 91 nt-1.98□□□□□ -2.73
ATG34Q12292 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt-2.03□□□□□ -2.73
ATG34Q12292 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt-2.2□□□□□ -2.76
ATG34Q12292 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-2.31□□□□□ -2.78
ATG34Q12292 YDR543CYDR543C 300 nt-2.41□□□□□ -2.8
ATG34Q12292 snR40snR40 97 nt-2.63□□□□□ -2.83
ATG34Q12292 snR87snR87 109 nt-2.67□□□□□ -2.84
ATG34Q12292 snR58snR58 96 nt-2.7□□□□□ -2.84
ATG34Q12292 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.74□□□□□ -2.85
ATG34Q12292 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-2.99□□□□□ -2.89
ATG34Q12292 snR75snR75 89 nt-3.29□□□□□ -2.94
ATG34Q12292 YJR162CYJR162C 351 nt-3.41□□□□□ -2.96
ATG34Q12292 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.76□□□□□ -3.01
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.3 ms