Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	Q12186	tA(UGC)Q	tA(UGC)Q	76 nt		0.09	□□□□□ -2.4
MSL5	Q12186	snR40	snR40	97 nt		0.09	□□□□□ -2.4
MSL5	Q12186	snR161	snR161	161 nt		0.06	□□□□□ -2.4
MSL5	Q12186	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
MSL5	Q12186	RPL41B	YDL133C-A	78 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
MSL5	Q12186	YOR335W-A	YOR335W-A	81 nt		-0.23	□□□□□ -2.45
MSL5	Q12186	snR6	snR6	112 nt		-0.32	□□□□□ -2.46
MSL5	Q12186	CDC65	tQ(CUG)M	72 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
MSL5	Q12186	URB1	YKL014C	5295 nt		-0.35	□□□□□ -2.47
MSL5	Q12186	YMR315W-A	YMR315W-A	108 nt		-0.36	□□□□□ -2.47
MSL5	Q12186	YHL009W-B	YHL009W-B	5409 nt		-0.4	□□□□□ -2.47
MSL5	Q12186	snR73	snR73	106 nt		-0.42	□□□□□ -2.48
MSL5	Q12186	snR33	snR33	183 nt		-0.49	□□□□□ -2.49
MSL5	Q12186	tP(UGG)Q	tP(UGG)Q	72 nt		-0.5	□□□□□ -2.49
MSL5	Q12186	tC(GCA)Q	tC(GCA)Q	76 nt		-0.58	□□□□□ -2.5
MSL5	Q12186	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
MSL5	Q12186	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
MSL5	Q12186	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
MSL5	Q12186	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
MSL5	Q12186	snR58	snR58	96 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
MSL5	Q12186	YOR309C	YOR309C	381 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
MSL5	Q12186	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
MSL5	Q12186	tY(GUA)Q	tY(GUA)Q	84 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
MSL5	Q12186	snR87	snR87	109 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
MSL5	Q12186	YBR126W-B	YBR126W-B	144 nt		-1.55	□□□□□ -2.66
MSL5	Q12186	YOL166W-A	YOL166W-A	156 nt		-1.91	□□□□□ -2.72
MSL5	Q12186	YDR543C	YDR543C	300 nt		-1.95	□□□□□ -2.72
MSL5	Q12186	YJL136W-A	YJL136W-A	84 nt		-2.36	□□□□□ -2.79
MSL5	Q12186	YJR162C	YJR162C	351 nt		-2.69	□□□□□ -2.84

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