Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.35□□□□□ -2.47
HAL9Q12180 YJL113WYJL113W 4647 nt-0.36□□□□□ -2.47
HAL9Q12180 URB1YKL014C 5295 nt-0.39□□□□□ -2.47
HAL9Q12180 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.49□□□□□ -2.49
HAL9Q12180 snR33snR33 183 nt-0.61□□□□□ -2.51
HAL9Q12180 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
HAL9Q12180 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
HAL9Q12180 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.64□□□□□ -2.51
HAL9Q12180 snR75snR75 89 nt-0.73□□□□□ -2.53
HAL9Q12180 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.74□□□□□ -2.53
HAL9Q12180 YNR077CYNR077C 255 nt-0.75□□□□□ -2.53
HAL9Q12180 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.8□□□□□ -2.54
HAL9Q12180 RPL41BYDL133C-A 78 nt-0.88□□□□□ -2.55
HAL9Q12180 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-0.88□□□□□ -2.55
HAL9Q12180 snR6snR6 112 nt-0.9□□□□□ -2.55
HAL9Q12180 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.9□□□□□ -2.55
HAL9Q12180 snR40snR40 97 nt-0.94□□□□□ -2.56
HAL9Q12180 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-0.95□□□□□ -2.56
HAL9Q12180 snR73snR73 106 nt-1.11□□□□□ -2.59
HAL9Q12180 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.16□□□□□ -2.6
HAL9Q12180 YOR309CYOR309C 381 nt-1.27□□□□□ -2.61
HAL9Q12180 snR58snR58 96 nt-1.46□□□□□ -2.64
HAL9Q12180 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.55□□□□□ -2.66
HAL9Q12180 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.71□□□□□ -2.68
HAL9Q12180 snR87snR87 109 nt-1.89□□□□□ -2.71
HAL9Q12180 YDR543CYDR543C 300 nt-2.06□□□□□ -2.74
HAL9Q12180 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.12□□□□□ -2.75
HAL9Q12180 YJR162CYJR162C 351 nt-2.91□□□□□ -2.88
HAL9Q12180 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.13□□□□□ -2.91
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