Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.78□□□□□ -2.28
TSR3Q12094 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt0.73□□□□□ -2.29
TSR3Q12094 CDC65tQ(CUG)M 72 nt0.72□□□□□ -2.29
TSR3Q12094 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt0.68□□□□□ -2.3
TSR3Q12094 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.6□□□□□ -2.31
TSR3Q12094 YOR309CYOR309C 381 nt0.33□□□□□ -2.36
TSR3Q12094 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.17□□□□□ -2.44
TSR3Q12094 snR33snR33 183 nt-0.39□□□□□ -2.47
TSR3Q12094 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
TSR3Q12094 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
TSR3Q12094 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.6□□□□□ -2.51
TSR3Q12094 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-0.75□□□□□ -2.53
TSR3Q12094 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.91□□□□□ -2.56
TSR3Q12094 YNR077CYNR077C 255 nt-1□□□□□ -2.57
TSR3Q12094 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-1.49□□□□□ -2.65
TSR3Q12094 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.71□□□□□ -2.68
TSR3Q12094 YDR543CYDR543C 300 nt-1.99□□□□□ -2.73
TSR3Q12094 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-2.32□□□□□ -2.78
TSR3Q12094 YJR162CYJR162C 351 nt-2.92□□□□□ -2.88
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.8 ms