Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 snR161snR161 161 nt-0.37□□□□□ -2.47
TMA46Q12000 URB1YKL014C 5295 nt-0.39□□□□□ -2.47
TMA46Q12000 snR77snR77 88 nt-0.42□□□□□ -2.48
TMA46Q12000 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt-0.51□□□□□ -2.49
TMA46Q12000 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
TMA46Q12000 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
TMA46Q12000 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.68□□□□□ -2.52
TMA46Q12000 snR33snR33 183 nt-0.7□□□□□ -2.52
TMA46Q12000 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-0.82□□□□□ -2.54
TMA46Q12000 snR75snR75 89 nt-0.97□□□□□ -2.56
TMA46Q12000 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-0.98□□□□□ -2.57
TMA46Q12000 snR6snR6 112 nt-1□□□□□ -2.57
TMA46Q12000 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-1.01□□□□□ -2.57
TMA46Q12000 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt-1.04□□□□□ -2.58
TMA46Q12000 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-1.07□□□□□ -2.58
TMA46Q12000 RPL41BYDL133C-A 78 nt-1.12□□□□□ -2.59
TMA46Q12000 snR40snR40 97 nt-1.12□□□□□ -2.59
TMA46Q12000 snR73snR73 106 nt-1.24□□□□□ -2.61
TMA46Q12000 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.32□□□□□ -2.62
TMA46Q12000 YOR309CYOR309C 381 nt-1.39□□□□□ -2.63
TMA46Q12000 YNR077CYNR077C 255 nt-1.48□□□□□ -2.65
TMA46Q12000 snR58snR58 96 nt-1.78□□□□□ -2.69
TMA46Q12000 YBR126W-BYBR126W-B 144 nt-1.79□□□□□ -2.7
TMA46Q12000 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt-1.85□□□□□ -2.71
TMA46Q12000 snR87snR87 109 nt-2.13□□□□□ -2.75
TMA46Q12000 YDR543CYDR543C 300 nt-2.38□□□□□ -2.79
TMA46Q12000 YOL166W-AYOL166W-A 156 nt-3.07□□□□□ -2.9
TMA46Q12000 YJR162CYJR162C 351 nt-3.28□□□□□ -2.93
TMA46Q12000 YJL136W-AYJL136W-A 84 nt-3.72□□□□□ -3
Retrieved 29 of 7,029 protein–RNA pairs in 5.6 ms