Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MitfQ08874 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MitfQ08874 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms