Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RhoP15409 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhoP15409 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
RhoP15409 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RhoP15409 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoP15409 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoP15409 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoP15409 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoP15409 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms