Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prf1P10820 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prf1P10820 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prf1P10820 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prf1P10820 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms