Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mfsd4b4J3QNS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mfsd4b4J3QNS5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms