Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trappc8E9PWG2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trappc8E9PWG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trappc8E9PWG2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms