Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm7870-201ENSMUST00000184467 616 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nde1Q9CZA6 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms